Du fait du gameplay qui laisse le joueur explorer différentes stratégies, The Last of us propose un cadre propice au questionnement de nos valeurs et de notre morale, notamment à propos du traitement des infectés. Il montre aussi dans l'histoire scénarisée, des différents cas de dilemmes moraux : par identification au personnage, le joueur sera donc amené à peser le pour et le contre et à réfléchir à ce qu'il aurait fait.